В новом - уже третьем эпизоде Half Life 2, который компания Valve обещает выпустить в следующем году, нас ожидает перелёт на вертолёте с ракетной базы "Белая роща" на Север в поисках корабля Борей и Джудит Моссман, которую могли захватить в плен комбайны.
В тех данных, что Аликс взяла в рушащейся Цитадели (это произошло в начале Episode One), было зашифровано сообщение от Джудит, а также координаты Борея. Последнее - краеугольный камень всех планов комбайнов.
Episode Two, равно как и Episode One, оставил немало интересных загадок. В частности то, что Илай сам хотел отправиться на Север, потому что боялся пленения Джудит, т.к. комбайны вытянули бы из её могза всю информацию. А д-р Кляйнер говорил, что если Джудит и схватят, то с неё мало что возьмут, хоть она и знает о секретном проекте. Но если в плен попадёт Илай, то может случится непоправимое, т.к. у него все планы сопротивления.
К сожалению, именно это и произошло в конце эпизода (когда уже нужно было садиться в вертолёт). Влетевший в ангар Советник комбайнов схватил Илая и высосал его мозг. То же самое он хотел сделать и с Аликс, но Пёс её вовремя успел спасти, бросившись на Советника.
В распоряжении комбайнов оказалась вся информация из мозга Илая. Но в то же время, сверхпортал на месте разрушенной Цитадели, через который должны были пройти на Землю новые войска Альянса, удалось закрыть.